EDI moduli obično se sastoje od nekoliko ključnih komponenti koje rade zajedno kako bi standardizirale i automatizirale prijenos podataka između poduzeća. Općenito govoreći, mogu se podijeliti na sloj konverzije podataka, sloj prijenosa komunikacije, sloj poslovnog mapiranja i sloj integracije sustava, svaki sa svojim odgovornostima.
Modul za pretvorbu podataka i mapiranje jedna je od temeljnih komponenti EDI-ja. Odgovoran je za pretvaranje neobrađenih podataka iz internih sustava poduzeća (kao što su ERP ili CRM podaci) u EDI poruke u skladu sa standardnim formatima, kao što su EDIFACT ili ANSI X12. Istodobno, također je odgovoran za obrnuto analiziranje podataka od vanjskih partnera, pretvarajući ih u strukturirane podatke prepoznatljive internim sustavima poduzeća. Pravila mapiranja polja i pravila provjere valjanosti podataka igraju ključnu ulogu u ovom procesu.
Komunikacijski i prijenosni modul prvenstveno je odgovoran za siguran prijenos EDI poruka između različitih poduzeća. Uobičajene metode uključuju VAN mreže, AS2 protokole ili API-metode prijenosa. Ovaj modul obično također uključuje redove poruka, mehanizme ponovnog pokušaja i praćenje statusa prijenosa kako bi se osigurala pouzdana isporuka podataka čak iu složenim mrežnim okruženjima.
Modul za integraciju sustava i upravljanje koristi se za ugradnju EDI mogućnosti u postojeće poslovne sustave poduzeća. Obično je duboko integriran s ERP-om, WMS-om ili sustavima upravljanja opskrbnim lancem za automatizaciju poslovnih procesa kao što su obrada narudžbi, isporuka i usklađivanje. Istovremeno, ovaj modul pruža funkcije zapisivanja, rukovanja iznimkama i nadzora, olakšavajući praćenje i upravljanje procesima razmjene podataka za tvrtke.